머신러닝 Experiment Management 쉽게 하기(feat. neptune ai)


  • neptune ai를 활용해 머신러닝 실험 관리를 더 편하게 하는 방법에 대해 작성한 글입니다
    • 키워드 : Machine learning experiment management

머신러닝 실험 관리

  • 머신러닝 실험 관리
    • 모델링을 할 때, 파라미터를 바꿔가며 실험함
    • 1) 초반엔 스프레드시트에 적어두기도 하지만, 실험이 많아지고 복잡해지면 노트북에서 돌린 내용을 스프레드시트에 누락할 수도 있고, 잘못 기록할 수 있음
    • 2) 필요할 경우 각 실험에서 나온 이미지 파일을 따로 저장해둬야 함
    • 3) 여러 모델을 한번에 비교하고 싶은 경우 1)이나 2)를 직접 눈으로 보고 비교해야 함
    • 이런 작업을 좀 더 수월하게 할 수 있도록 Machine Learning Experiment Management Tool들이 개발됨
  • 머신러닝 실험 관리에 대한 내용은 제 블로그의 머신러닝 실험을 도와줄 Python Sacred 소개에 간단히 정리해둠
    • Sacred는 직접 설치하고, mongodb 연결하는 등 약간의 개발 지식이 필요함
    • 기타 도구들은 reddit에 많이 나옴
  • 이번에 소개할 neptune ai는 개발 지식이 전혀 필요없고, 코드 몇줄만 추가하면 끝남


neptune ai

  • 홈페이지
  • “Keep all of your ML stuff organized to advance faster”
    • 모든 머신러닝 재료들을 저장하고 빠르게 접근할 수 있도록 만듬
    • 모든 것들이 백업되고, 다른 사람과 공유할 수 있음
  • 주요 기능 : 밑에서 자세히 다룸
    • 1) 실험 과정에서 나오는 각종 데이터 저장
    • 2) 실험 버전 관리, 실험 비교
    • 3) 노트북 버전 관리, Diff 확인 가능
    • 4) 협업을 위한 위키 기능
  • 단, 서비스를 제공하고 오픈소스는 아님
  • 여러 Framework와 도구와 결합 가능
    • sklearn, pytorch, keras, tf, fast.ai, sacred, mlflow, lgbm 등 다양한 라이브러리 지원
  • 가격
    • 오픈소스가 아닌 서비스를 제공하고 있기 때문에 가격을 확인할 필요가 있음
    • 좋은 점은 개인 목적(Individual)인 경우 Free로 사용할 수 있음. 따라서 개인 프로젝트 또는 Kaggle을 할 때 유용할 듯
    • 팀에서 사용할 경우 프로젝트 1개만 제공하고, 저장 용량이 10GB임. 실험 관리용으로만 쓴다면 충분히 괜찮은 용량이고 구입하기 전 테스트할 목적으로 사용해도 좋음
    • Team Pro는 월 79달러
    • 스타트업에겐 50%의 할인을 제공하고 있고, 연구자나 비영리적 조직에서 무료로 사용할 수 있음
  • Python이 아닌 R에서도 사용할 수 있음. How to track and collaborate on R experiments with Neptune 참고
  • 이제 주요 기능을 neptune ai에서 제공하는 샘플 프로젝트를 보며 설명


1) 실험 과정에서 나오는 각종 데이터 저장

  • 프로젝트 메인 페이지
    • credit default prediction 참고함
    • 각종 실험에 대한 정보가 저장됨. 실험에서 사용한 노트북도 볼 수 있음
  • 커스텀해서 보고 싶은 지표를 앞에 둘 수 있고, 특정 태그만 있는 실험을 검색할 수 있음
  • 실험 CRED-81을 클릭하면 아래와 같이 나옴
    • 왼쪽에 보면 Charts, Logs, Monitoring, Artifacts, Source code, Parameters 등이 있음
  • 각종 데이터 저장
    • Metric
      • Chart에 저장
    • Hyperparameters
      • Parameters에 저장
    • Data versions
      • Artifacts에 저장
    • Model files
      • Artifacts에 저장
    • Images
      • Logs에 저장
    • Source Code
      • Source Code에 저장
  • Charts
    • 사용자가 지정한 iter별 auc, production precision을 볼 수 있음
  • Logs
    • 각종 로그가 저장됨
    • 좋다고 생각한 부분은 이미지도 저장할 수 있는 점. matplotlib의 figure를 넘기면 저장됨
  • Monitoring은 CPU, RAM 사용량, stderr, stdout이 보임
  • Artifacts
    • 사용자가 저장한 모델 pkl 파일, train, valid data 파일이 저장됨
  • Source code
    • 소스 코드를 선택하면 저장된 파일을 확인할 수 있음
  • Parameters
    • 사용자가 초기에 세팅한 파라미터가 저장됨
  • Details
    • 실험 관련 메타 데이터가 저장됨


2) 실험 버전 관리, 실험 비교

  • Experiment 메인에서 여러 실험을 체크하고 Compare 클릭
  • Metric과 Chart를 확인할 수 있음


3) 노트북 버전 관리, Diff 확인 가능

  • 프로젝트의 Notebooks를 클릭하면 아래와 같이 업로드한 노트북이 보임
    • 여러 노트북 파일을 업로드하고, 노트북 파일을 버전 관리할 수 있음
  • Checkpoint로 버전 관리
  • 노트북 파일 Diff 확인


4) 협업을 위한 위키 기능

  • 프로젝트의 Wiki를 클릭하면 아래와 같이 작성한 문서를 확인할 수 있음



사용 방법

회원 가입 및 프로젝트 확인

  • 링크를 통해 회원 가입
  • 기본적으로 생성된 프로젝트가 있음
    • sandbox
  • sandbox를 클릭하면 실험 및 노트북 등을 볼 수 있음
  • Show me how를 클릭해서 사용 방법 확인
    • 1) Neptune client library 설치
      pip3 install neptune-client
    
    • 2) API Token 확인
      • API Key를 기억하거나, 환경 변수에 추가하기


Notebook 작성

  • neptune init

      import neptune
    
      PARAMS = {
          'num_threads': 4,
          'seed':777,
          'metric':'auc'
      }
    	
      neptune.init('user_id/sandbox', api_token='토큰 값 입력')
    
  • 실험 생성
    • 실험 객체 생성시 https://ui.neptune.ai/~~~ 이런 URL이 출력됨
      neptune.create_experiment(name='ml_modeling', params=PARAMS)
      neptune.append_tag('test_tag')
    
  • 코드 중간 중간에 저장하고 싶은 metric, artifact 등을 저장

      figure = plt.figure()
    	
      plt.plot(loss, label="loss")
      plt.xlabel('epoch')
      plt.ylabel('loss')
    	
      neptune.log_metric('loss', loss)
      neptune.log_image('loss_figure', figure)
      neptune.log_artifact('model_weights.h5')
      neptune.set_property(‘data_version’, sha1(data_train))
    
  • 실험을 닫기(종료)

      neptune.stop()
    
  • 실험 객체 생성, 닫는게 귀찮으면 with로 감싸주면 됨

      with neptune.create_experiment(name='ml_modeling', params=PARAMS) as exp:
          experiment code
          neptune.log_metric('loss', loss)
          neptune.log_image('loss_figure', figure)
          neptune.log_artifact('model_weights.h5')
    


neptune ai에 노트북 업로드하기(notebook 확장 프로그램 설치)

  • jupyter notebook 파일을 쉽게 업로드할 수 있도록 Jupyter Extension을 만듬
  • 설치

      pip3 install neptune-notebooks
    
  • Enable

      jupyter nbextension enable --py neptune-notebooks
    
  • Jupyter Notebook 켜서 확인
    • Configure 클릭
  • API Token 복사 후 붙여넣기
  • 이제 Upload, Download가 활성화됨
  • Upload 클릭 후 체크포인트 생성
  • neptune ai UI에서 확인 가능
  • 아까 업로드한 노트북에서 print를 수정해서 다시 upload함
    • 동일한 이름에서 checkpoint 업로드
  • 다시 UI에 가보면 체크포인트 2개를 확인할 수 있음
  • Compare 클릭 후 2개를 비교


결론 및 정리

  • neptune ai는 머신러닝 실험 관리할 때 유용함
  • 꼭 머신러닝이 아니여도 데이터 기반해서 여러 시뮬레이션을 돌릴 때 활용하면 좋음
  • 오픈소스가 아니지만, 개인 계정은 무료로 사용 가능
    • Kaggle 등의 대회에 참여할 때 활용해보길 추천
  • 노트북 업로드, 모델 파일 저장, 이미지 저장, 실험 비교 등 다양한 기능을 제공함
    • Production 환경에 가기 전, 여러 실험을 돌릴 때 사용하면 좋은 도구
  • 설치가 필요없고 간단한 코드 몇 줄만 추가하면 되서 사용성이 좋음
  • 회사에서 사용한다면, Team Plan으로 테스트해본 후 가입하면 좋을듯
    • 실험 플랫폼을 만들어줄 엔지니어링팀이 있다면 이 프로그램을 먼저 사용해보고 아이디어를 얻을 수 있을듯



Reference


카일스쿨 유튜브 채널을 만들었습니다. 데이터 사이언스, 성장, 리더십, BigQuery 등을 이야기할 예정이니, 관심 있으시면 구독 부탁드립니다 :)

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